交互模式和 R 脚本
交互模式
使用 R 的最基本方式是交互模式。你键入命令并立即从 R 获取结果
使用 R 作为计算器
通过在操作系统的命令提示符下键入 R 或在 Windows 上执行 RGui 来启动 R. 你可以在下面看到 Linux 上的交互式 R 会话的屏幕截图：
这是 Windows 上的 RGui，是 Windows 下 R 的最基本的工作环境： 
在 > 符号之后，可以输入表达式。一旦输入表达式，结果将由 R 显示。在上面的屏幕截图中，R 用作计算器：类型
1+1
立即看到结果，2。领先的 [1] 表示 R 返回一个向量。在这种情况下，向量只包含一个数字（2）。
第一个情节
R 可用于生成图。以下示例使用数据集 PlantGrowth，它与 R 一起作为示例数据集
将以下所有行中的 int 键入 R 提示符，该提示符不以 ## 开头。以 ## 开头的行用于记录 R 将返回的结果。
data(PlantGrowth)
str(PlantGrowth)
## 'data.frame': 30 obs. of 2 variables:
## $ weight: num 4.17 5.58 5.18 6.11 4.5 4.61 5.17 4.53 5.33 5.14 ...
## $ group : Factor w/ 3 levels "ctrl","trt1",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
anova(lm(weight ~ group, data = PlantGrowth))
## Analysis of Variance Table
##
## Response: weight
## Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)
## group 2 3.7663 1.8832 4.8461 0.01591 *
## Residuals 27 10.4921 0.3886
## ---
## Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
boxplot(weight ~ group, data = PlantGrowth, ylab = "Dry weight")
创建以下图：
data(PlantGrowth) 加载示例数据集 PlantGrowth，其是干燥的植物群的记录，其受到两种不同的处理条件或根本没有处理（对照组）。该数据集以 PlantGrowth 的名称提供。这样的名称也称为变量 。
要加载你自己的数据，以下两个文档页面可能会有所帮助：
str(PlantGrowth) 显示有关已加载的数据集的信息。输出表明 PlantGrowth 是 data.frame，它是表的 R 名称。data.frame 包含两列和 30 行。在这种情况下，每行对应一个工厂。两列的详细信息显示在以 $ 开头的行中：第一列称为 weight 并包含数字（num，相应植物的干重）。第二栏，group，包含植物所经受的处理。这是分类数据，在 R 中称为 factor。阅读有关数据帧的更多信息 。
为了比较三个不同组的干质量，使用 anova(lm( ... )) 进行单向 ANOVA。weight ~ group 的意思是“比较列 weight 的值，按列 group 的值进行分组”。这在 R.中称为公式 .data = ... 指定可以找到数据的表的名称。
结果表明，除其他外，三组之间存在显着差异（列 Pr(>F)），p = 0.01591）。必须执行像 Tukey 测试这样的事后测试，以确定哪些组的平均值存在显着差异。
boxplot(...) 创建数据的箱形图。要绘制的值来自哪里。weight ~ group 意思是：“画出列权重的值相对于所述柱 group 的值 ylab = ... 指定 y 轴的标签的更多信息：。基地绘图
输入 q() 或 Ctrl - D 退出 R 会话。
R 脚本
要记录你的研究，最好将用于计算的命令保存在文件中。为此，你可以创建 R 脚本。R 脚本是一个简单的文本文件，包含 R 命令。
创建一个名为 plants.R 的文本文件，并使用以下文本填充它，其中一些命令在上面的代码块中是熟悉的：
data(PlantGrowth)
anova(lm(weight ~ group, data = PlantGrowth))
png("plant_boxplot.png", width = 400, height = 300)
boxplot(weight ~ group, data = PlantGrowth, ylab = "Dry weight")
dev.off()
通过在终端中输入脚本来执行脚本（操作系统的终端，而不是上一节中的交互式 R 会话！）
R --no-save <plant.R >plant_result.txt
文件 plant_result.txt 包含计算结果，就好像你已将它们输入到交互式 R 提示中一样。因此，你的计算记录在案。
新命令 png 和 dev.off 用于将箱线图保存到磁盘。这两个命令必须包含绘图命令，如上例所示。png("FILENAME", width = ..., height = ...) 打开一个新的 PNG 文件，其中包含指定的文件名，宽度和高度（以像素为单位）。dev.off() 将完成绘图并将绘图保存到磁盘。在调用 dev.off() 之前不会保存输出。