調整 heatmap 中的引數

鑑於：

x  <- as.matrix(mtcars)

通過載入以下庫，可以使用 heatmap.2 - heatmap 的最新優化版本：

require(gplots)
heatmap.2(x)

要在熱圖中新增標題，x 或 y 標籤，你需要設定 main，xlab 和 ylab：

heatmap.2(x, main = "My main title: Overview of car features", xlab="Car features", ylab = "Car brands")

如果你希望為熱圖定義自己的調色盤，可以使用 colorRampPalette 函式設定 col 引數：

heatmap.2(x, trace="none", key=TRUE, Colv=FALSE,dendrogram = "row",col =  colorRampPalette(c("darkblue","white","darkred"))(100))

你可以注意到，y 軸上的標籤（汽車名稱）不適合圖中。為了解決這個問題，使用者可以調整 margins 引數：

heatmap.2(x, trace="none", key=TRUE,col = colorRampPalette(c("darkblue","white","darkred"))(100), margins=c(5,8))

此外，我們可以通過調整 lhei 和 lwid 來改變熱圖的每個部分的尺寸（關鍵直方圖，樹狀圖和熱圖本身）：

如果我們只想顯示行（或列）樹形圖，我們需要設定 Colv=FALSE（或 Rowv=FALSE）並調整 dendogram 引數：

heatmap.2(x, trace="none", key=TRUE, Colv=FALSE, dendrogram = "row", col = colorRampPalette(c("darkblue","white","darkred"))(100), margins=c(5,8), lwid = c(5,15), lhei = c(3,15))

要更改圖例標題，標籤和軸的字型大小，使用者需要在 par 列表中設定 cex.main, cex.lab, cex.axis：

par(cex.main=1, cex.lab=0.7, cex.axis=0.7)
heatmap.2(x, trace="none", key=TRUE, Colv=FALSE, dendrogram = "row", col = colorRampPalette(c("darkblue","white","darkred"))(100), margins=c(5,8), lwid = c(5,15), lhei = c(5,15))